Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef17Q80U35 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Arhgef17Q80U35 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef17Q80U35 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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