Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NischQ80TM9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
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