Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms