Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lamp3Q7TST5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lamp3Q7TST5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lamp3Q7TST5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lamp3Q7TST5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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