Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf516Q7TSH3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf516Q7TSH3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms