Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms