Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek5Q7TSC3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms