Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms