Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms