Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno2Q7TNB8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms