Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl2Q78Y63 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms