Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vma21Q78T54 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vma21Q78T54 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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