Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snd1Q78PY7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms