Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ubfd1Q78JW9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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