Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms