Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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