Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms