Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SpopQ6ZWS8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms