Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms