Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms