Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms