Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms