Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp34Q6ZQ93 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp34Q6ZQ93 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms