Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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NinlQ6ZQ12 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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NinlQ6ZQ12 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinlQ6ZQ12 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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NinlQ6ZQ12 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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NinlQ6ZQ12 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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NinlQ6ZQ12 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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NinlQ6ZQ12 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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