Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot1Q6ZQ08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms