Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm3bQ6ZPY7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm3bQ6ZPY7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms