Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms