Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms