Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms