Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms