Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scaf4Q6PFF0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms