Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms