Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms