Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms