Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms