Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms