Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms