Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gapvd1Q6PAR5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms