Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak2Q6P9N8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak2Q6P9N8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms