Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms