Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZH9

Rasgrp3, RAS, guanyl-releasing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp3Q6NZH9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgrp3Q6NZH9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgrp3Q6NZH9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms