Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms