Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SphkapQ6NSW3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms