Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms