Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms