Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms