Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms