Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms