Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp9cQ66X01 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp9cQ66X01 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms