Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CilpQ66K08 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms